Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPGP40121 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPGP40121 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPGP40121 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAPGP40121 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAPGP40121 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAPGP40121 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAPGP40121 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPGP40121 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPGP40121 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms