Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FDFT1P37268 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms