Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP1P29466 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP1P29466 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP1P29466 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP1P29466 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms