Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms