Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms