Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HRCP23327 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HRCP23327 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HRCP23327 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HRCP23327 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HRCP23327 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HRCP23327 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HRCP23327 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HRCP23327 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HRCP23327 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HRCP23327 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HRCP23327 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HRCP23327 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HRCP23327 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HRCP23327 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HRCP23327 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HRCP23327 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HRCP23327 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HRCP23327 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HRCP23327 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HRCP23327 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HRCP23327 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HRCP23327 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HRCP23327 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HRCP23327 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HRCP23327 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HRCP23327 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HRCP23327 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HRCP23327 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HRCP23327 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HRCP23327 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HRCP23327 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HRCP23327 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HRCP23327 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HRCP23327 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HRCP23327 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HRCP23327 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HRCP23327 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HRCP23327 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HRCP23327 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HRCP23327 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HRCP23327 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HRCP23327 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HRCP23327 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HRCP23327 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HRCP23327 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HRCP23327 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HRCP23327 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HRCP23327 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HRCP23327 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HRCP23327 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HRCP23327 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HRCP23327 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HRCP23327 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HRCP23327 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms