Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK11BP21127 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK11BP21127 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK11BP21127 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK11BP21127 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK11BP21127 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK11BP21127 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK11BP21127 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK11BP21127 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK11BP21127 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK11BP21127 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK11BP21127 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK11BP21127 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK11BP21127 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK11BP21127 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK11BP21127 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK11BP21127 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK11BP21127 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK11BP21127 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK11BP21127 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms