Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DESP17661 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DESP17661 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DESP17661 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DESP17661 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DESP17661 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DESP17661 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DESP17661 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DESP17661 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DESP17661 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DESP17661 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DESP17661 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DESP17661 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DESP17661 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DESP17661 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DESP17661 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DESP17661 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DESP17661 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DESP17661 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DESP17661 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DESP17661 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DESP17661 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DESP17661 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DESP17661 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DESP17661 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DESP17661 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DESP17661 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DESP17661 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms