Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
ITGB4P16144 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB4P16144 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms