Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms