Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRFP10586 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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PTPRFP10586 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRFP10586 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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