Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI2P10070 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI2P10070 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI2P10070 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI2P10070 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI2P10070 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI2P10070 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI2P10070 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI2P10070 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GLI2P10070 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
GLI2P10070 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI2P10070 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI2P10070 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI2P10070 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI2P10070 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI2P10070 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI2P10070 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI2P10070 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI2P10070 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI2P10070 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI2P10070 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI2P10070 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI2P10070 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI2P10070 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI2P10070 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI2P10070 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI2P10070 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI2P10070 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI2P10070 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI2P10070 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms