Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB1P08034 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB1P08034 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB1P08034 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB1P08034 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB1P08034 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB1P08034 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB1P08034 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB1P08034 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB1P08034 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB1P08034 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB1P08034 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB1P08034 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB1P08034 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB1P08034 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB1P08034 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB1P08034 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB1P08034 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB1P08034 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB1P08034 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB1P08034 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB1P08034 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB1P08034 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB1P08034 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB1P08034 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB1P08034 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB1P08034 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB1P08034 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB1P08034 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB1P08034 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms