Protein–RNA interactions for Protein: P04234

CD3D, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3DP04234 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD3DP04234 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD3DP04234 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD3DP04234 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD3DP04234 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD3DP04234 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD3DP04234 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD3DP04234 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD3DP04234 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD3DP04234 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD3DP04234 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD3DP04234 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD3DP04234 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD3DP04234 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD3DP04234 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD3DP04234 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms