Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TK1P04183 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TK1P04183 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms