Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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