Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms