Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP4K4O95819 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms