Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAPBO95292 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAPBO95292 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAPBO95292 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPBO95292 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms