Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRATO95237 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRATO95237 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRATO95237 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRATO95237 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRATO95237 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRATO95237 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms