Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL3O95236 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL3O95236 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms