Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms