Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAK2O60296 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK2O60296 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK2O60296 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms