Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHGDHO43175 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms