Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GNPATO15228 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GNPATO15228 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GNPATO15228 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GNPATO15228 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPATO15228 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPATO15228 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPATO15228 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPATO15228 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms