Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBDO15205 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBDO15205 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBDO15205 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UBDO15205 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms