Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAPO00193 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAPO00193 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAPO00193 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMAPO00193 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAPO00193 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAPO00193 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAPO00193 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAPO00193 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAPO00193 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAPO00193 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAPO00193 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAPO00193 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAPO00193 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAPO00193 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAPO00193 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAPO00193 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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