Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB9F8W1W9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms