Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEURL1BA8MQ27 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms