Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUBP2Q9Y5Y2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms