Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms