Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms