Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms