Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS5Q9UPZ3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms