Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF8Q9UPP1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF8Q9UPP1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms