Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms