Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC9Q9UKV0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms