Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCAN3Q9UKA8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms