Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL1Q9UK58 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms