Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP35Q9P2H5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
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