Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSKIPQ9P0R6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSKIPQ9P0R6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSKIPQ9P0R6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSKIPQ9P0R6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSKIPQ9P0R6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSKIPQ9P0R6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSKIPQ9P0R6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSKIPQ9P0R6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSKIPQ9P0R6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSKIPQ9P0R6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSKIPQ9P0R6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms