Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PODXL2Q9NZ53 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms