Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCLQ9NW38 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms