Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOMER3Q9NSC5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms