Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK3Q9BYB0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHANK3Q9BYB0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms