Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms