Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms