Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTA3Q9BTC8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms