Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms