Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPIFA3Q9BQP9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms